姓名: 职晓阳
学科: 微生物学
职称/人才类别: 副研究员
电话/传真: 0871-5033335
电子邮件: xyzhi@ynu.edu.cn
简历：
1. 1999.09-2003.07，河南师范大学，生命科学学院，生命科学专业，获学士学位；
2. 2004.09-2007.07，云南大学，生命科学学院，微生物学，获硕士学位；
3. 2008.11-2010.05，美国俄克拉荷马大学，环境基因组研究中心，公派联合培养博士生；
4. 2007.09-2010.07，云南大学，生命科学学院，微生物学专业，获博士学位；
5. 2010.08-2016.11，云南大学，生命科学学院微生物研究所，助理研究员；
6. 2014.02-2015.02，复旦大学，物理系理论生命研究中心，访问学者。
7. 2016.12，云南大学，生命科学学院微生物研究所，副研究员。
研究领域：
主要从事原核微生物系统学和进化基因组学研究。重点开展以下3个方面的研究工作：原核微生物基础代谢通路相关基因与蛋白的分子进化；原核微生物特定类群系统发育基因组学；生态适应的组学机制。目前正在进行的具体研究课题包括：
1. Molecular evolution of histidine biosynthesis related enzymes.
2. Molecular evolution of aromatic amino acids biosynthesis related enzymes.
3. The origin of the order Bifidobacteriales
4. The phylogenomics of the genus Rhizobium
5. The phylogenomics of family Thermoactinomycetaceae
6. Comparative transcriptomics of Thermoactinospora rubra YIM 77501
7. Comparative genomics of 15 strains of Arthrobacterphenanthrenivorans
8. Low temperature adaptation of mesophilic archaea
获奖及荣誉：
1．2010年教育部自然科学二等奖（排名第四），项目名称：“新疆青海高盐环境可培养嗜盐放线菌多样性研究”；
2．2009年云南省自然科学奖一等奖（排名第四），项目名称：“放线菌系统学研究”；
代表论著：
发表SCI 47篇, 第一/通讯作者SCI 19篇, 总引次719, 他引698, H指数: 15。参与出版论著两部：《放线菌系统学——原理、方法与实践》，《伯杰氏细菌系统学手册》（第二版第五卷）。
论文清单: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/?term=Xiao-Yang+Zhi。
部分代表论文如下：
1. Zhi XY*, Zhao J, Yang LL, Huang Y. The underlying mechanisms of genetic innovation and speciation in the family Corynebacteriaceae: a phylogenomics approach. Mol Phylogenet Evol. 2017, 107: 246-255. (IF: 3.792)
2. Yang LL, Tang SK, Huang Y, Zhi XY*. Low Temperature Adaptation Is Not the Opposite Process of High Temperature Adaptation in Terms of Changes in Amino Acid Composition. Genome Biol Evol. 2015, 7(12): 3426-3433. (IF: 4.098)
3. He ST†, Zhi XY†, Jiang H, Yang LL, Wu JY, Zhang YG, Hozzein WN, Li WJ. Biogeography of Nocardiopsis strains from hypersaline environments of Yunnan and Xinjiang Provinces, western China. Sci Rep. 2015, 5: 13323. (IF: 5.228)
4. Zhi XY*, Yao JC, Li HW, Huang Y, Li WJ. Genome-wide identification, domain architectures and phylogenetic analysis provide new insights into the early evolution of shikimate pathway in prokaryotes. Mol Phylogenet Evol. 2014, 75:154-164. (IF: 3.79)
5. Zhi XY*, Yao JC, Tang SK, Huang Y, Li HW, Li WJ. The futalosine pathway played an important role in menaquinone biosynthesis during early prokaryote evolution. Genome Biol Evol. 2014, 6: 149-160. (IF: 4.098)
6. Li HW, Zhi XY*, Yao JC, Zhou Y, Tang SK, Klenk HP, Zhao J, Li WJ. Comparative genomic analysis of the genus Nocardiopsis provides new insights into its genetic mechanisms of environmental adaptability. PLoS ONE. 2013, 8(4): e61528. (IF: 3.057)
7. Zhi XY, Tang SK, Li WJ. Genus I. Jiangella Song, Li, Wang, Chen, Zhang and Xu 2005. In Bergey's Manual of Determinative Bacteriology Volume 5, The Actinobacteria, Whitman W.B., Goodfellow M., Kämpfer P., et al., Eds. 2012 Springer Press.
8. Zhi XY, Zhao W, Li WJ, Zhao GP. Prokaryotic systematics in the genomics era. Antonie van Leeuwenhoek. 2011, 101(1): 21-34. (IF: 1.944)
9. Zhi XY, Zhao W, Li WJ, Zhao GP. Working towards a Molecular Systematics Library for Prokaryotes: a perspective. The Bulletion of BISMiS. 2011, 2(2): 125-134.
10. Zhi XY, Li WJ, Stackebrandt E. An update of the structure and 16S rRNA gene sequence-based definition of higher ranks of the class Actinobacteria, with the proposal of two new suborders and four new families and emended descriptions of the existing higher taxa. Int J Syst Evol Microbiol. 2009, 59(3): 589-608. (ESI-1%TOP, Citations: 252)
承担科研项目情况：
1. 原核生物细胞质膜组分合成酶及其基因的分子进化研究，国家自然科学基金地区项目，编号31560309. 2016.1-2019.12
2. 放线菌门核糖体进化与系统分类学研究，国家自然科学基金青年项目，编号31100008. 2012.1-2014.12
